När docent Carl Gregergren knatar ner till insjön han har till granne upptäcker han att vattnet sjunkit undan dramatiskt. Carl börjar dokumentera vattennivån i Lillsjön, som sjunker undan centimeter för centimeter. På andra sidan vattnet ligger ett företag med en anonym hemsida utan information om vad de sysslar med. Carl förlorar sig i jakten på vad företaget håller på med och om de har med de sjunkande vattennivåerna att göra. Med hjälp av en miljörörelse får han kontakt med experter inom hydrologi, kemi, mikro- och molekylärbiologi i jakten på sanningen. Samtidigt finns det de som får veta vad Carl har börjat nysta i - och gör allt för att förhindra sanningen från att komma fram. Drama Aqua är en spänningsroman om stora som små miljöfrågor, deras påverkan på våra vardagsliv, och de förödande konsekvenser som kan följa när människan missbrukar ny teknik.