Engang var Mogens Amdi Petersen en toneangivende ungdomsoprører og idealist, der ville fordele magt og ressourcer retfærdigt i verden. Nu bor han i luksus i Mexico, isoleret midt i kartelland.  I Amdi forsvinder kaster Rune Skyum-Nielsen nyt lys over Tvindimperiets leder og hans sidste tilflugtssted.  Den dramatiske fortælling om en mytisk skikkelse i moderne dansk historie er bygget op om et fortidsspor og et nutidsspor, der bugter sig ind og ud mellem hinanden. Det ene spor skildrer Amdis opbygning af Tvindskolerne og den pyramidelignende organisation Lærergruppen. Her ofrer medlemmerne alt for hans linje, der undervejs skifter fra revolutionær socialisme til neokolonialisme. Det andet spor følger forfatterens forsøg på at forstå, hvorfor Amdi – efterlyst af Interpol siden 2013 – og hans følgere er endt i et brutalt hjørne af Mexico.  Amdi forsvinder er en selvstændig fortsættelse af den anmelderroste Amdi bliver til fra 2022